AG Struktur und Stabilität des (Epi)Genoms

Die Arbeitsgruppe Struktur und Stabilität des (Epi)Genoms unter der Leitung von Dr. phil. nat. Robert Hänsel-Hertsch erforscht die Existenz und Bedeutung von altersbedingten Strukturveränderungen des Epigenoms und deren Auswirkungen auf die Krankheitsentstehung. Daher ist es möglich, dass sich die Struktur des Genoms mit dem Alter signifikant verändert und Säugetiere für die Entwicklung von Krankheiten wie Krebs oder degenerativen Erkrankungen prädisponieren. Zusätzlich untersucht die AG, ob definierte alters- oder krebsbedingte Strukturveränderungen des Epigenoms von diagnostischem und therapeutischem Wert sind.

Die Arbeitsgruppe adressiert die folgenden konzeptionellen Fragestellungen:

  • Sind Epigenomveränderungen „passenger“ oder „driver“ des Alterns von Säugetieren?
  • Existieren bestimmte strukturelle Zustände des Epigenoms die Genominstabilität und die Krankheitsentstehung fördern?
  • Können altersbedingte Epigenomveränderungen unterdrückt werden und die Lebenszeit von Säugetieren verlängern?
  • Sind definierte Zustände des Epigenoms von diagnostischem und therapeutischem Wert?

Wir entwickeln und nutzen Genomik-Technologien, um diese Fragen zu beantworten.

Ausgewählte Publikationen

R. Hänsel-Hertsch, J. Spiegel, G. Marsico, D. Tannahill, S. Balasubramanian.
Genome-wide mapping of endogenous G-quadruplex DNA structures by chromatin immunoprecipitation and high-throughput sequencing.
Nature Protocols (2018), 13: 551-564, 5-year IF 2018: 15.1.
PubMed PMID: 29470465

S. Mao, A. T. Ghanbarian, J. Spiegel, S. Martínez Cuesta, D. Beraldi, M. Di Antonio, G. Marsico, R. Hänsel-Hertsch, D. Tannahill, S. Balasubramanian.
DNA G-quadruplex structures mould the DNA methylome.
Nature Structure & Molecular Biology (2018), 25: 951-957, 5-year IF 2018: 12.7.
PubMed PMID: 30275516

A. Parry, M. Hoare, D. Bihary, R. Hänsel-Hertsch, S. Smith, K. Tomimatsu, S. Balasubramanian, H. Kimura, S. Samarajiwa, M. Narita.
NOTCH-mediated non-cell autonomous regulation of chromatin structure during senescence.
Nature Communications (2018), 9: 1840, 5-year IF 2018: 13.8.
PubMed PMID: 30275516

R. Hänsel-Hertsch, M. Di Antonio, S. Balasubramanian.
DNA G‑quadruplexes in the human genome: detection, functions and therapeutic potential.
Nature Reviews Molecular Cell Biology (2017), 18: 279-284, 5-year IF 2018: 49.6.
PubMed PMID: 28225080

R. Hänsel-Hertsch, D. Beraldi, S.V. Lensing, G. Marsico, K. Zyner, A. Parry, M. Di Antonio, J. Pike, H. Kimura, M. Narita, D. Tannahill, S. Balasubramanian.
G-quadruplex structures mark human regulatory chromatin.
Nature Genetics (2016), 10: 1267-72, 5-year IF 2018: 31.1.
PubMed PMID: 27618450

R. Hänsel, F. Löhr, L. Trantirek, V. Dötsch.
High-resolution insight into G-overhang architecture.
Journal of the American Chemical Society (2013), 135: 2816-24, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 23339582

L.M. Luh, R. Hänsel, F. Löhr, D.K. Kirchner, K. Krauskopf, S. Pitzius, B. Schäfer, P. Tufar, I. Corbeski, P. Güntert, V. Dötsch.
Molecular crowding drives active Pin1 into nonspecific complexes with endogenous proteins prior to substrate recognition.
Journal of the American Chemical Society (2013), 135: 13796-803, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 23968199

I. Krstić, R. Hänsel, O. Romainczyk, J.W. Engels, V. Dötsch, T.F. Prisner.
Long Range Distance Measurements on Nucleic Acids in cells by Pulsed EPR Spectroscopy.
Angewandte Chemie International Edition (2011), 50: 5070-4, 5-year IF 2018: 12.3.
PubMed PMID: 21506223

R. Hänsel, F. Löhr, S. Foldynova-Trantirkova, E. Bamberg, L. Trantirek, V. Dötsch.
The parallel G-quadruplex structure of vertebrate telomeric repeat sequences is not the preferred folding topology under physiological conditions.
Nucleic Acids Research (2011), 39: 5768-75, 5-year IF 2018: 11.2.
PubMed PMID: 21450807

R. Hänsel, S. Foldynova-Trantirkova, F. Löhr, J. Buck, E. Bamberg, H. Schwalbe, V. Dötsch, L. Trantirek.
Evaluation of parameters critical for observing nucleic acids inside living Xenopus laevis oocytes by in-cell NMR spectroscopy.
Journal of the American Chemical Society (2009), 131: 15761-8, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 19824671

Dr. Robert Hänsel-Hertsch

Dr. Robert Hänsel-Hertsch

Zentrum für Molekulare Medizin Köln
Universität zu Köln
ZMMK-Forschungsgebäude (Gebäude 66)
Robert-Koch-Str. 21
50931 Köln

Telefon
+49 221 478-96988
Zur Person
Akademischer Werdegang
06/2013–11/2013 PhD in Biochemie (summa cum laude, 27/11/2013), Cancer Research UK Cambridge Institut, Universität Cambridge, UK (Mentor: Sir Prof. Shankar Balasubramanian)
11/2009–06/2013 Goethe Universität, Institut für Biophysikalische Chemie, Frankfurt/Main (Mentor: Prof. Volker Dötsch)
01/2012–03/2012 Tokyo Universität, Grad. Schule Pharm. Wissenschaften Japan (Mentor: Prof. Ichio Shimada)
10/2003–10/2009 Diplom in Biochemie (summa cum laude, 05/10/2009), Goethe Universität, Institut für Biophysikalische Chemie, Frankfurt/Main (Mentor: Prof. Volker Dötsch)
Klinischer Werdegang
Seit 08/2019 Junior Gruppenleiter, Center for Molecular Medicine Cologne (CMMC), University of Cologne
11/2013–07/2019 Postdoc, Cancer Research UK Cambridge Institute, University of Cambridge, UK (Mentor: Sir Prof. Shankar Balasubramanian)
Auszeichnungen
2017 Herchel Smith Postdoc-Stipendium
2013 EMBO Lang-Zeit Stipendium
2013 DAAD Postdoc-Stipendium
2011 JSPS “Predoctoral” Stipendium für Nordamerikanische und Europäische Wissenschaftler
2011 Richard-Ernst-Preis für innovative Beiträge im Magnetresonanzfeld
2010 Fonds der chemischen Industrie PhD Stipendium
2009–2010 Procter & Gamble Preis für die beste Diplomarbeit in der Biochemie
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