AG Struktur und Stabilität des (Epi)Genoms
Die Arbeitsgruppe Struktur und Stabilität des (Epi)Genoms unter der Leitung von Dr. phil. nat. Robert Hänsel-Hertsch erforscht die Existenz und Bedeutung von altersbedingten Strukturveränderungen des Epigenoms und deren Auswirkungen auf die Krankheitsentstehung. Daher ist es möglich, dass sich die Struktur des Genoms mit dem Alter signifikant verändert und Säugetiere für die Entwicklung von Krankheiten wie Krebs oder degenerativen Erkrankungen prädisponieren. Zusätzlich untersucht die AG, ob definierte alters- oder krebsbedingte Strukturveränderungen des Epigenoms von diagnostischem und therapeutischem Wert sind.
Die Arbeitsgruppe adressiert die folgenden konzeptionellen Fragestellungen:
- Sind Epigenomveränderungen „passenger“ oder „driver“ des Alterns von Säugetieren?
- Existieren bestimmte strukturelle Zustände des Epigenoms die Genominstabilität und die Krankheitsentstehung fördern?
- Können altersbedingte Epigenomveränderungen unterdrückt werden und die Lebenszeit von Säugetieren verlängern?
- Sind definierte Zustände des Epigenoms von diagnostischem und therapeutischem Wert?
Wir entwickeln und nutzen Genomik-Technologien, um diese Fragen zu beantworten.
R. Hänsel-Hertsch, J. Spiegel, G. Marsico, D. Tannahill, S. Balasubramanian.
Genome-wide mapping of endogenous G-quadruplex DNA structures by chromatin immunoprecipitation and high-throughput sequencing.
Nature Protocols (2018), 13: 551-564, 5-year IF 2018: 15.1.
PubMed PMID: 29470465
R. Hänsel-Hertsch, Simeone A, Shea A, Hui WWI, Zyner KG, Marsico G, Rueda OM, Bruna A, Martin A, Zhang X, Adhikari S, Tannahill D, Caldas C, Balasubramanian S.
Landscape of G-quadruplex DNA structural regions in breast cancer.
Nat Genet. 2020 Sep;52(9):878-883
PubMed PMID: 32747825
A. Parry, M. Hoare, D. Bihary, R. Hänsel-Hertsch, S. Smith, K. Tomimatsu, S. Balasubramanian, H. Kimura, S. Samarajiwa, M. Narita.
NOTCH-mediated non-cell autonomous regulation of chromatin structure during senescence.
Nature Communications (2018), 9: 1840, 5-year IF 2018: 13.8.
PubMed PMID: 30275516
R. Hänsel-Hertsch, M. Di Antonio, S. Balasubramanian.
DNA G‑quadruplexes in the human genome: detection, functions and therapeutic potential.
Nature Reviews Molecular Cell Biology(2017), 18: 279-284, 5-year IF 2018: 49.6.
PubMed PMID: 28225080
R. Hänsel-Hertsch, D. Beraldi, S.V. Lensing, G. Marsico, K. Zyner, A. Parry, M. Di Antonio, J. Pike, H. Kimura, M. Narita, D. Tannahill, S. Balasubramanian.
G-quadruplex structures mark human regulatory chromatin.
Nature Genetics (2016), 10: 1267-72, 5-year IF 2018: 31.1.
PubMed PMID: 27618450
R. Hänsel, F. Löhr, L. Trantirek, V. Dötsch.
High-resolution insight into G-overhang architecture.
Journal of the American Chemical Society (2013), 135: 2816-24, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 23339582
L.M. Luh, R. Hänsel, F. Löhr, D.K. Kirchner, K. Krauskopf, S. Pitzius, B. Schäfer, P. Tufar, I. Corbeski, P. Güntert, V. Dötsch.
Molecular crowding drives active Pin1 into nonspecific complexes with endogenous proteins prior to substrate recognition.
Journal of the American Chemical Society (2013), 135: 13796-803, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 23968199
I. Krstić, R. Hänsel, O. Romainczyk, J.W. Engels, V. Dötsch, T.F. Prisner.
Long Range Distance Measurements on Nucleic Acids in cells by Pulsed EPR Spectroscopy.
Angewandte Chemie International Edition (2011), 50: 5070-4, 5-year IF 2018: 12.3.
PubMed PMID: 21506223
R. Hänsel, F. Löhr, S. Foldynova-Trantirkova, E. Bamberg, L. Trantirek, V. Dötsch.
The parallel G-quadruplex structure of vertebrate telomeric repeat sequences is not the preferred folding topology under physiological conditions.
Nucleic Acids Research (2011), 39: 5768-75, 5-year IF 2018: 11.2.
PubMed PMID: 21450807
R. Hänsel, S. Foldynova-Trantirkova, F. Löhr, J. Buck, E. Bamberg, H. Schwalbe, V. Dötsch, L. Trantirek.
Evaluation of parameters critical for observing nucleic acids inside living Xenopus laevis oocytes by in-cell NMR spectroscopy.
Journal of the American Chemical Society (2009), 131: 15761-8, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 19824671
