AG Struktur und Stabilität des (Epi)Genoms

Die Arbeitsgruppe Struktur und Stabilität des (Epi)Genoms unter der Leitung von Dr. phil. nat. Robert Hänsel-Hertsch erforscht die Existenz und Bedeutung von altersbedingten Strukturveränderungen des Epigenoms und deren Auswirkungen auf die Krankheitsentstehung. Daher ist es möglich, dass sich die Struktur des Genoms mit dem Alter signifikant verändert und Säugetiere für die Entwicklung von Krankheiten wie Krebs oder degenerativen Erkrankungen prädisponieren. Zusätzlich untersucht die AG, ob definierte alters- oder krebsbedingte Strukturveränderungen des Epigenoms von diagnostischem und therapeutischem Wert sind.

Die Arbeitsgruppe adressiert die folgenden konzeptionellen Fragestellungen:

  • Sind Epigenomveränderungen „passenger“ oder „driver“ des Alterns von Säugetieren?
  • Existieren bestimmte strukturelle Zustände des Epigenoms die Genominstabilität und die Krankheitsentstehung fördern?
  • Können altersbedingte Epigenomveränderungen unterdrückt werden und die Lebenszeit von Säugetieren verlängern?
  • Sind definierte Zustände des Epigenoms von diagnostischem und therapeutischem Wert?

Wir entwickeln und nutzen Genomik-Technologien, um diese Fragen zu beantworten.

Ausgewählte Publikationen

R. Hänsel-Hertsch, J. Spiegel, G. Marsico, D. Tannahill, S. Balasubramanian.
Genome-wide mapping of endogenous G-quadruplex DNA structures by chromatin immunoprecipitation and high-throughput sequencing.
Nature Protocols (2018), 13: 551-564, 5-year IF 2018: 15.1.
PubMed PMID: 29470465

R. Hänsel-Hertsch, Simeone A, Shea A, Hui WWI, Zyner KG, Marsico G, Rueda OM, Bruna A, Martin A, Zhang X, Adhikari S, Tannahill D, Caldas C, Balasubramanian S.
Landscape of G-quadruplex DNA structural regions in breast cancer.
Nat Genet. 2020 Sep;52(9):878-883
PubMed PMID: 32747825

A. Parry, M. Hoare, D. Bihary, R. Hänsel-Hertsch, S. Smith, K. Tomimatsu, S. Balasubramanian, H. Kimura, S. Samarajiwa, M. Narita.
NOTCH-mediated non-cell autonomous regulation of chromatin structure during senescence.
Nature Communications (2018), 9: 1840, 5-year IF 2018: 13.8.
PubMed PMID: 30275516

R. Hänsel-Hertsch, M. Di Antonio, S. Balasubramanian.
DNA G‑quadruplexes in the human genome: detection, functions and therapeutic potential.
Nature Reviews Molecular Cell Biology(2017), 18: 279-284, 5-year IF 2018: 49.6.
PubMed PMID: 28225080

R. Hänsel-Hertsch, D. Beraldi, S.V. Lensing, G. Marsico, K. Zyner, A. Parry, M. Di Antonio, J. Pike, H. Kimura, M. Narita, D. Tannahill, S. Balasubramanian.
G-quadruplex structures mark human regulatory chromatin.
Nature Genetics (2016), 10: 1267-72, 5-year IF 2018: 31.1.
PubMed PMID: 27618450

R. Hänsel, F. Löhr, L. Trantirek, V. Dötsch.
High-resolution insight into G-overhang architecture.
Journal of the American Chemical Society (2013), 135: 2816-24, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 23339582

L.M. Luh, R. Hänsel, F. Löhr, D.K. Kirchner, K. Krauskopf, S. Pitzius, B. Schäfer, P. Tufar, I. Corbeski, P. Güntert, V. Dötsch.
Molecular crowding drives active Pin1 into nonspecific complexes with endogenous proteins prior to substrate recognition.
Journal of the American Chemical Society (2013), 135: 13796-803, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 23968199

I. Krstić, R. Hänsel, O. Romainczyk, J.W. Engels, V. Dötsch, T.F. Prisner.
Long Range Distance Measurements on Nucleic Acids in cells by Pulsed EPR Spectroscopy.
Angewandte Chemie International Edition (2011), 50: 5070-4, 5-year IF 2018: 12.3.
PubMed PMID: 21506223

R. Hänsel, F. Löhr, S. Foldynova-Trantirkova, E. Bamberg, L. Trantirek, V. Dötsch.
The parallel G-quadruplex structure of vertebrate telomeric repeat sequences is not the preferred folding topology under physiological conditions.
Nucleic Acids Research (2011), 39: 5768-75, 5-year IF 2018: 11.2.
PubMed PMID: 21450807

R. Hänsel, S. Foldynova-Trantirkova, F. Löhr, J. Buck, E. Bamberg, H. Schwalbe, V. Dötsch, L. Trantirek.
Evaluation of parameters critical for observing nucleic acids inside living Xenopus laevis oocytes by in-cell NMR spectroscopy.
Journal of the American Chemical Society (2009), 131: 15761-8, 5-year IF 2018: 14.7.
PubMed PMID: 19824671

Dr. phil. nat.--Hänsel-Hertsch-Robert
Dr. phil. nat. Robert Hänsel-Hertsch

Zentrum für Molekulare Medizin Köln
Universität zu Köln
ZMMK-Forschungsgebäude (Gebäude 66)
Robert-Koch-Str. 21
50931 Köln


Akademischer Werdegang
06/2013–11/2013PhD in Biochemie (summa cum laude, 27/11/2013), Cancer Research UK Cambridge Institut, Universität Cambridge, UK (Mentor: Sir Prof. Shankar Balasubramanian)
11/2009–06/2013Goethe Universität, Institut für Biophysikalische Chemie, Frankfurt/Main (Mentor: Prof. Volker Dötsch)
01/2012–03/2012Tokyo Universität, Grad. Schule Pharm. Wissenschaften Japan (Mentor: Prof. Ichio Shimada)
10/2003–10/2009Diplom in Biochemie (summa cum laude, 05/10/2009), Goethe Universität, Institut für Biophysikalische Chemie, Frankfurt/Main (Mentor: Prof. Volker Dötsch)
Klinischer Werdegang
Seit 08/2019Junior Gruppenleiter, Center for Molecular Medicine Cologne (CMMC), University of Cologne
11/2013–07/2019Postdoc, Cancer Research UK Cambridge Institute, University of Cambridge, UK (Mentor: Sir Prof. Shankar Balasubramanian)
Auszeichnungen
2017Herchel Smith Postdoc-Stipendium
2013EMBO Lang-Zeit Stipendium
2013DAAD Postdoc-Stipendium
2011JSPS “Predoctoral” Stipendium für Nordamerikanische und Europäische Wissenschaftler
2011Richard-Ernst-Preis für innovative Beiträge im Magnetresonanzfeld
2010Fonds der chemischen Industrie PhD Stipendium
2009–2010Procter & Gamble Preis für die beste Diplomarbeit in der Biochemie

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